Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros dos Rios Preto e Paraibuna (PS1)
A Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros dos Rios Preto e Muriaé está inserida na mesorregião Sul-sudoeste, onde estão municípios como o de Juiz de Fora. Abrangendo um total de 22 sedes municipais e apresentando uma área de drenagem de 7.222 km², a bacia possui uma população estimada de 561.952 habitantes. O clima na bacia é considerado semi-úmido, com período seco durando entre quatro e cinco meses por ano, situando-se a disponibilidade hídrica entre 10 e 20 litros por segundo por quilômetro quadrado. O Índice de Qualidade das Águas na bacia em 2005 apresentou-se predominantemente no nível Médio. É importante destacar o IQA Bom verificado no rio Novo próximo à sua foz no rio Pomba, condição que vem sendo mantida desde 2002, e o IQA Ruim verificado no rio Paraibuna nos trechos situados a jusante da cidade de Juiz de Fora, a jusante da UHE Paciência e na ponte de acesso à represa João Penido. O Comitê de Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros dos Rios Preto e Muriaé encontra-se em processo de formação.
Bacia Hidrográfica do Rio Pomba e Muriaé (PS2)
A Bacia Hidrográfica do Rio Pomba e Muriaé situa-se na mesorregião da Zona da Mata, onde estão municípios como Juiz de Fora e Muriaé. Abrangendo um total de 58 sedes municipais e apresentando área de drenagem de 13.552 km², a bacia possui uma população estimada de 776.608 habitantes. O clima na bacia é considerado semi-úmido, com período seco durando entre quatro e cinco meses por ano, situando-se a disponibilidade hídrica entre 10 e 20 litros por segundo por quilômetro quadrado. O Índice de Qualidade das Águas apresentou-se predominantemente no nível Médio em 2005. Destacam-se negativamente os resultados verificados no rio Glória e no rio Carangola. Em ambos os casos, o IQA era bom em 2004 e passou a Médio em 2005. O Comitê de Bacia Hidrográfica do Rio Pomba e Muriaé encontra-se em processo de formação.
